Neue Lösung für varvis® API – der varvis-connector
Die zunehmende Komplexität genetischer Analysen erfordert leistungsfähige digitale Prozesse und eine effiziente Verarbeitung großer Datenmengen. Labor Berlin entwickelt im Bereich Bioinformatik und Datenwissenschaften eigene Softwarelösungen zur Unterstützung moderner diagnostischer Workflows.
Mit dem varvis-connector stellt Labor Berlin eine GPLv3 Open-Source-Lösung zur Verfügung, die die Integration und Nutzung der Analyseplattform varvis® in der humangenetischen Diagnostik unterstützt. varvis® ist eine von Limbus Medical Technologies entwickelte Plattform zur Analyse, Interpretation und Verwaltung genomischer Daten.
Was ist der varvis-connector?
Der varvis-connector ist ein Python-basiertes Softwarepaket zur Anbindung an die varvis®-API. Die Lösung unterstützt die automatisierte Verarbeitung und Integration genomischer Daten in diagnostische Abläufe.
Das Paket umfasst:
- eine Programmierschnittstelle (API)
- ein Command-Line-Interface (CLI)
- Datenvalidierung und Fehlerhandling
- Funktionen zur Verarbeitung genetischer Analyse- und Qualitätsdaten.
Lizenzierung
Der varvis-connector wird als Open-Source-Software öffentlich zur Verfügung gestellt.
Für kommerzielle Lizenzierungen kontaktieren Sie bitte das Labor Berlin IP- & Technologiemanagement.
Die Software steht über GitHub sowie über PyPI zur Verfügung und kann von Entwickler:innen, Forschungseinrichtungen und diagnostischen Laboren genutzt werden.
Bioinformatik und Datenwissenschaften bei Labor Berlin
Die Entwicklung des varvis-connectors erfolgte in der Abteilung Bioinformatik und Datenwissenschaften von Labor Berlin.
Der Bereich unterstützt moderne diagnostische Verfahren durch:
- Datenintegration
- Prozessautomatisierung
- bioinformatische Analysen
- digitale Workflowentwicklung
- Datenwissenschaftliche Auswertungen
Ziel ist die kontinuierliche Weiterentwicklung effizienter und qualitativ hochwertiger diagnostischer Prozesse.
