NGS-Bakterien

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• Material

  Bakterienisolate oder primär steriles mikrobiologisches Material

• Methode

  Sequenzierung

• Dauer

  5 Tage

• Akkreditiert

  Nein

• Indikation

  Verdacht auf eine Infektion durch Bakterien in primär sterilen, kulturnegativen Materialien. Differenzierung von kultivierten Bakterien, die biochemsich oder massenspektrometrisch nicht differenzierbar sind.

• Praeanalytik

  Probenmenge:
  Einzelkolonie eines Bakterienisolats oder Gewebestücke mit einer Größe ab wenigen Milimetern und Flüssigkeiten ab 50-100ml

  Untersuchungsnethode:
  Die Untersuchung mittels Sequenzierung ist sinnvoll, wenn die Differenzierung eines Bakterienisolats aus einem primär sterilen Material biochemisch oder massenspektrometrisch nicht gelingt.

  Aus primär sterilem Material, aus dem keine Keime kultiviert werden konnten, kann die Sequenzierung zum Erregernachweis führen.

• Bewertung

  Die Sequenzen werden gegen eine Datenbank abgeglichen. Die Menge wird als Anzahl der sequenzierten 18S Abschnitte (Reads) auf dem Befund angegeben. Relevanz wird in Abhängigkeit der Spezies, der Menge und des Materials individuell abgeschätzt.

• Durchfuehrung

  1x/Woche