NGS-Pilze

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• Material

  Pilzisolate oder primär steriles mikrobiologisches Material

• Methode

  Sequenzierung

• Dauer

  5 Tage

• Akkreditiert

  Ja

• Indikation

  Verdacht auf eine Infektion durch Pilze in primär sterilen, kulturnegativen Materialien

• Praeanalytik

  Probenmenge:
  Einzelkolonie eines Bakterienisolats
  Gewebestücke mit einer Größe ab wenigen Milimetern und Flüssigkeiten ab 50-100ml

  Aus primär sterilem Material, aus dem keine Keime kultiviert werden konnten, kann die Sequenzierung zum Erregernachweis führen.

• Bewertung

  Die Sequenzen werden gegen eine Datenbank abgeglichen. Die Menge wird als Anzahl der sequenzierten 18S Abschnitte (Reads) auf dem Befund angegeben. Relevanz wird in Abhängigkeit der Spezies, der Menge und des Materials individuell abgeschätzt.

• Durchfuehrung

  nach Absprache