zurück

  • Synonym

    CALR-Sequenzierung, CALR-Mutationen, Calreticulin-Mutationen
  • Material

    EDTA-Knochenmark 5 ml
    oder
    EDTA-Blut 10 ml
  • Methode

    DNA-Sequenzierung
  • Dauer

    2 Wochen
  • Referenzbereich

    keine Mutation nachweisbar

  • Akkreditiert

    Ja
  • Indikation

    Verdacht auf Myeloproliferative Neoplasie

  • Praeanalytik

    In der Regel ist EDTA-Blut als Untersuchungsmaterial ausreichend.

    Bitte unterschriebene Einverständniserklärung zur Durchführung von genetischen Untersuchungen und ggf. zur Aufbewahrung von Probenmaterial in einer Probenbank (Link) beifügen. Diese Einverständniserklärung ist auch Bestandteil der Anforderungsscheine (Link).

  • Bewertung

    Mutationen im Gen für Calreticulin CALR finden sich in etwa einem Drittel der Fälle von Essentieller Thrombozythämie (ET) oder Primärer Myelofibrose (PMF). Es handelt sich dabei um frameshift-Mutationen im neunten (letzten codierenden) Exon von CALR, die zu einer Verschiebung des Leserasters und damit zu einem veränderten Carboxy-Terminus des CALR-Proteins führen. 
    Ganz überwiegend finden sich Typ 1- oder Typ 2-Mutationen. Bei Typ 1 liegt eine 52 bp-Deletion vor (c.1099_1150del52, p.L367fs*46) und bei Typ II eine 5 bp-Insertion (c.1054_1055insTTGTC, p.K385fs*47).
    Mutationen in JAK2, MPL und CALR treten praktisch exklusiv voneinander auf. Selten finden sich CALR-Mutationen auch bei anderen myeloischen Neoplasien (MDS, AML). Bei Polyzythämia vera kommen CALR-Mutationen so gut wie nie vor.

    Durch Klampfl et al. (2013, PMID: 24325356) wurden insgesamt 36 Mutationen charakterisiert, die wie folgt als Mutationstypen benannt wurden (Genom-Annotation nach hg18):

    – Typ 1: c.1092_1143del chr19:12915565_12915616del
    – Typ 2: c.1154_1155insTTGTC chr19:12915627_12915628insTTGTC
    – Typ 3: c.1095_1140del chr19:12915568_12915613del
    – Typ 4: c.1102_1135del chr19:12915575_12915608del
    – Typ 5: c.1091_1142del chr19:12915564_12915615del
    – Typ 6: c.1094_1139del chr19:12915567_12915612del
    – Typ 7: c.1102_1153del chr19:12915575_12915626del
    – Typ 8: c.1104_1137del chr19:12915577_12915610del
    – Typ 9: c.1140del chr19:12915613del
    – Typ 10: c.1154delinsTGTGTC chr19:12915627delinsTGTGTC
    – Typ 11 [c.1092G>C;1095_1140del] chr19:12915565G>C; chr19:12915568_12915613del
    – Typ 12: c.1098_1131del chr19:12915571_12915604del
    – Typ 13: c.1100_1134delinsA chr19:12915573_12915607delinsA
    – Typ 14: c.1101_1134del chr19:12915574_12915607del
    – Typ 15 [c.1102_1135del;1145C>G] chr19:12915575_12915608del; chr19:12915618C>G
    – Typ 16: c.1102_1137delinsCA chr19:12915575_12915610delinsCA
    – Typ 17 [c.1104_1137del;1148A>T] chr19:12915577_12915610del; chr19:12915621A>T
    – Typ 18: c.1104_1155del chr19:12915577_12915628del
    – Typ 19: c.1110_1140del chr19:12915583_12915613del
    – Typ 20: c.1118_1136del chr19:12915591_12915609del
    – Typ 21: c.1118_1145delinsCGTTTA chr19:12915591_12915618delinsCGTTTA
    – Typ 22: c.1120_1123del chr19:12915593_12915596del
    – Typ 23: c.1120_1131delinsTGCGT chr19:12915593_12915604delinsTGCGT
    – Typ 24: c.1120_1138del chr19:12915593_12915611del
    – Typ 25: c.1122_1141delinsA chr19:12915595_12915614delinsA
    – Typ 26: c.1122del chr19:12915595del
    – Typ 27: c.1123_1125delinsTGTTT chr19:12915596_12915598delinsTGTTT
    – Typ 28: c.1131_1152del chr19:12915604_12915625del
    – Typ 29: c.1135_1152delinsCCTCCTCTTTGTCT chr19:12915608_12915625delinsCCTCCTCTTTGTCT
    – Typ 30: c.1137_1154delinsCCATCCTTGTC chr19:12915610_12915627delinsCCATCCTTGTC
    – Typ 31 [c.1151A>G;1154_1155insTTGTC] chr19:12915624A>G; chr19:12915627_12915628insTTGTC
    – Typ 32: c.1153_1154delinsTGTC chr19:12915626_12915627delinsTGTC
    – Typ 33: c.1154_1155insATGTC chr19:12915627_12915628insATGTC
    – Typ 34: c.1154_delinsCTTGTC chr19:12915627delinsCTTGTC
    – Typ 35: c.1154delinsTTTGTC chr19:12915627delinsTTTGTC
    – Typ 36: c.1155_1156insTGTCG chr19:12915628_12915629insATGTC

  • Durchfuehrung

    Sequenzierung von Exon 9

Labor Berlin – Charité Vivantes GmbH
Tel: +49 (30) 405 026-800

E-Mail senden